Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地所画出人类肠道的微生态系统目录!

2022-01-10 03:13:55 来源:
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近日,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的图表分析报告之中,来自欧洲分子生物学实验室等机构的图表分析者们通过图表分析将生物消化系统动物细胞三组之中所有已知的芽孢遗传物质汇编成了一个大型的图表库,从而就能帮助图表分析医护人员透彻即使芽孢基因和蛋白之间的共同点,以及其对生物健康的受到影响。

芽孢遍及代谢物另有,其能够产生蛋白质来受到影响机体消化、健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于人体动物细胞三组成员的数量要能用体细胞还要多,包括芽孢、寄生虫和其它动物细胞;为了理解芽孢在生物生物学之中所扮演的关键性主角,图表分析者们通常会在实验室之中分离并对其培养,随后在对芽孢顺利进行DNA脱氧核糖核酸,然而现在很多芽孢还无法在实验室的生态系统之中被培养繁殖。

为了获得这些芽孢的相关接收者,图表分析医护人员采取了另另有一种方法,他们从生态系统之中(比如消化系统)搜集一般来说取样,随后在对整个取样之中的DNA顺利进行脱氧核糖核酸,然后利用计算机方法对来自一般来说取样之中的数千种类群的个体遗传物质顺利进行修葺,这种方法被称做宏遗传物质学技术,该技术能作为一种替代方法对单个类群的DNA顺利进行分离和脱氧核糖核酸。

图表分析者Rob Finn表示,去年包括我们在内的三个独立开发团队修葺了数以百计个消化系统动物细胞三组遗传物质,而最大的缺陷就是这些开发团队所给与的结果是否具有可比性,以及是否能将这些结果汇编成为一个非常全面的清单。现在图表分析医护人员已经从生物消化系统之中超过4600种芽孢种群之中汇编了20万个遗传物质和1.7亿个蛋白质序列,这种新型的图表库(确立的生物胃消化系统遗传物质集合和确立的胃消化系统蛋白质附录)揭示了机体消化系统的很大动植物,并为促使顺利进行消化系统动物细胞三组图表分析开端了道路。

图表分析者绘出出的这个很大的附录是动物细胞三组图表分析的一个基石,愿景或将能为图表分析者们备有非常宝贵的森林资源来图表分析生物消化系统生态之中每一种芽孢所扮演的关键性主角。这项图表分析声称,超过70%被检测到的芽孢从而在实验室之中被成功培养过,而其在体内的活性仍然未知,而这类芽孢之中最大的群体就是Comantemales;图表分析者表示,见到Comantemales如此国际上敢说一个欢笑,这就突显出了我们的确对消化系统之中的芽孢相符合,我希望这个附录能帮助生物接收者学家和生物化学在愿景几年补足这一知识值得注意。

该图表库/附录搜集的所有图表都能在Skype森林资源Mgnify之中获得,其能帮助图表分析者们分析动物细胞的遗传物质图表并且与举例来说的图表库顺利进行对比;随着世界各地图表分析开发团队不断发布重新图表库,该附录不会扩大到包括其它机体躯干的动物细胞三组,比如眼部或口腔内部等躯干。之后图表分析者表示,这一附录的汇编愿景或为动物细胞学家和临床图表分析医护人员备有非常丰富的森林资源,然而图表分析医护人员不会在之中南美洲、亚洲和非洲大陆等代表性不足的内陆地区发现更多重新芽孢类群,现在图表分析医护人员并不相符并不相同群体之中芽孢动植物的差异性和变化具体情况。

早期注解:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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