转录辅助因子对不同类型的核心启动子兼具特异性

2022-02-07 03:20:49 来源:

激活辅助因子（transcriptional cofactor， COF）在增强子与操纵子之间传输调控案发现场，是激活启动时和蛋白质表达的整体效应物。虽然已声称某些COF比其他COF更为偏好某些操纵子并不一定，但是各有不同COF对各有不同操纵子显示显露的内在特异性的程度尚为不清楚。在一项一新科学研究中所，来自奥地利维也纳生物中所心分子病理学科学研究三组的科学研究人员在黑腹跳蚤S2细胞中所使用高通量操纵子活性测来筛选23个COF启动时7.2万个候选整体操纵子（core promoter， CP）的意志力。具体科学研究结果于2019年5月初15日在线发表在Nature期刊上，论文结尾为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些科学研究人员注意到到整体操纵子的差异启动时，这表明COF与特定并不一定的整体操纵子之间实际上着各有不同的调节偏好或者说“兼容性（compatibilities）”。这些功能各有不同的整体操纵子在TATA盒、南岸操纵子积体电路（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等已知的序列积体电路上差异性地富集，并在内源性位点上显示显露各有不同的染色质特性。值得注意的是，这些整体操纵子并不一定在它们的H3K4me3和H3K4me1标有上实际上各有不同的相对丰度，这表明这些三组蛋白粘贴可能很难区分反式调节因子而不是操纵子和增强子并不一定的顺式调节积体电路。这些科学研究人员声称在人细胞和另外两种跳蚤细胞中所声称了各有不同COF-整体操纵子兼容性的实际上。为此，他们发现了分别偏好TATA盒和CpG岛操纵子的COF。COF和整体操纵子之间的各有不同兼容性很难解释各有不同的增强子如何特异性地启动时各有不同三组的蛋白质、有所不同蛋白质内的可变操纵子（alternative promoter）和有所不同操纵子内的各有不同激活起始位点。综上所述，COF-整体操纵子兼容性可能是跳蚤和人类等各有不同物种中所各有不同激活程序的基础。原始显露处：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]